El término bioinformática tiene sus orígenes en la década de los setenta y se relacionaba con las aplicaciones computacionales diseñadas para manejar y analizar secuencias de origen biológico, principalmente secuencias de proteínas o del ADN proveniente de diversos organismos. En la actualidad, se extiende a áreas muy variadas que van desde tareas simples, como la adquisición directa de los datos a partir de los ensayos de secuenciación de DNA o de proteínas cuando se utilizan técnicas como espectrofotometría de masas, hasta el desarrollo de software para el almacenamiento y análisis de los datos, lo que implica en muchos casos el desarrollo de algoritmos que requieren de un conocimiento tanto matemáticos, como biológicos.